45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0119 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  100 
 
 		 466 aa  936    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  63.09 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  42.06 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  39.36 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  34.55 
 
 		 428 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.61 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  30.15 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  29.65 
 
 		 436 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  29.07 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  30.39 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  29.07 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  24.23 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  22.91 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  22.4 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.89 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  27.66 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.67 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.34 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  19.27 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.36 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.56 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  23.15 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  31 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  21.71 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  33.71 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.63 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.46 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.7 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  26 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.62 
 
 		 500 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>