77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5246 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  61.11 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  55.1 
 
 		 99 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  54.72 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  54.05 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  53.77 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  43 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  44.76 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  33.65 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  40.96 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  22.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2807  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 436 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  31.48 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.68 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.5 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1374  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 159 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 123 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.52 
 
 		 129 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 114 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  29.25 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2760  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.12 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.49 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.04 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 		 111 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 112 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.41 
 
 		 114 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 127 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>