More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2443 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2403  extracellular solute-binding protein  99.55 
 
 
222 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  99.55 
 
 
222 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3711  extracellular solute-binding protein  51.91 
 
 
236 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2702  extracellular solute-binding protein  51.07 
 
 
237 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.75 
 
 
257 aa  92  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
264 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1126  hypothetical protein  26.34 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1130  hypothetical protein  26.34 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.58 
 
 
271 aa  78.2  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  24.77 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.92 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  31.08 
 
 
501 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  27.83 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
604 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.91 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.16 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  28.11 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  24.09 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.11 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 
285 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.04 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  26.89 
 
 
590 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.19 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.73 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.73 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.73 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.73 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
264 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  32.14 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
245 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.18 
 
 
266 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0861  extracellular solute-binding protein family 3  25.32 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  27.65 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
265 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.9 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
299 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
260 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
295 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  24.14 
 
 
266 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  28.76 
 
 
295 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  28.76 
 
 
295 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.52 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.52 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.52 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
285 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.61 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>