60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1768 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  35.68 
 
 
216 aa  148  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  40.87 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  37.31 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  36.97 
 
 
211 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  35.9 
 
 
228 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  35.64 
 
 
225 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  37.32 
 
 
222 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  36.97 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  36 
 
 
209 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  35 
 
 
213 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  35.68 
 
 
220 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  36.49 
 
 
214 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  38.81 
 
 
232 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  36.41 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  35.61 
 
 
206 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  36.41 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  36.02 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  33.8 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  33 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  35 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.66 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  33.65 
 
 
222 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  32.86 
 
 
214 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  33.01 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  29.27 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  32.16 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  31.6 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  30.77 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  30.77 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  31.28 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  30.69 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  31.75 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  33.66 
 
 
209 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  34.16 
 
 
209 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  30.46 
 
 
207 aa  89  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  31.1 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  33.66 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  35 
 
 
215 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  31.1 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  30.85 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  28.77 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  30.61 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  27.5 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  28.57 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  27.8 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  25.76 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  28.57 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  28.64 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  22.38 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  28.32 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  22.75 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  27.23 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  22.84 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  27.64 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  26.6 
 
 
205 aa  55.5  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  23.91 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  22.16 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  27.42 
 
 
204 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>