53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1587 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  45.29 
 
 
180 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  44.71 
 
 
186 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  40.23 
 
 
172 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  34.36 
 
 
218 aa  85.1  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  35.22 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  35.59 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  31.88 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  32.43 
 
 
268 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  27.83 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  30.2 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.8 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  34 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  32.14 
 
 
237 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.13 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  30.82 
 
 
229 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  30.46 
 
 
246 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  32.48 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  30.4 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  51.6  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  33.04 
 
 
271 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  28.3 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  33.94 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  34.62 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  34.41 
 
 
122 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  32.63 
 
 
110 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  32.63 
 
 
113 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  48.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  32.65 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  37.63 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  31.31 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  28.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  27.97 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  26.71 
 
 
245 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  32.99 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  45.1  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  29.47 
 
 
113 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  25.71 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  35.56 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  25.71 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  33.01 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  32.04 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  24.58 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  35.87 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  26.61 
 
 
257 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  30.34 
 
 
171 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>