More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0657 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  100 
 
 
158 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  78.21 
 
 
158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  76.43 
 
 
158 aa  244  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  75.8 
 
 
158 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  72.44 
 
 
157 aa  228  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  56.96 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  55.77 
 
 
161 aa  179  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  60 
 
 
160 aa  178  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  57.59 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  52.23 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  60 
 
 
158 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  55.06 
 
 
159 aa  174  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  55.06 
 
 
159 aa  174  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  55.7 
 
 
159 aa  175  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  53.5 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  51.92 
 
 
157 aa  171  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  52.56 
 
 
158 aa  170  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  50.96 
 
 
162 aa  169  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  54.49 
 
 
159 aa  168  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  51.33 
 
 
159 aa  153  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  54.42 
 
 
168 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  44.52 
 
 
170 aa  134  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  41.33 
 
 
168 aa  120  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  43.94 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  46.21 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  43.38 
 
 
141 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  43.94 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  42.34 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  42.42 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  41.79 
 
 
141 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  41.22 
 
 
140 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  39.39 
 
 
141 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  43.51 
 
 
141 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  40.46 
 
 
141 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  38.97 
 
 
146 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  40.88 
 
 
144 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
141 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
140 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
140 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
141 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  42.11 
 
 
141 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
141 aa  103  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  41.22 
 
 
142 aa  103  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  40.15 
 
 
140 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  39.42 
 
 
144 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 
140 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  37.04 
 
 
169 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
142 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  38.93 
 
 
141 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  40.44 
 
 
143 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  37.88 
 
 
142 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 
141 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  39.69 
 
 
140 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  38.06 
 
 
144 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
143 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  39.29 
 
 
145 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  38.69 
 
 
148 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.52 
 
 
142 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  38.81 
 
 
141 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
140 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
140 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  39.71 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  40.15 
 
 
143 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
141 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  41.79 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
142 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  39.69 
 
 
145 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  40.3 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  41.79 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  38.35 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>