More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5035 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  97.34 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  91.49 
 
 		 187 aa  323  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  91.49 
 
 		 187 aa  323  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  91.49 
 
 		 187 aa  323  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  82.8 
 
 		 187 aa  320  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  81.87 
 
 		 192 aa  310  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  78.38 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  86.17 
 
 		 187 aa  302  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.96 
 
 		 187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  84.57 
 
 		 192 aa  299  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  78.77 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75.66 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 191 aa  297  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 193 aa  295  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  76.37 
 
 		 191 aa  295  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.21 
 
 		 189 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  82.98 
 
 		 187 aa  293  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  75.94 
 
 		 190 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 193 aa  291  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 191 aa  290  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  78.61 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  78.61 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  75.14 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  79.68 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 190 aa  287  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  74.19 
 
 		 198 aa  287  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  80.11 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  73.26 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  73.12 
 
 		 189 aa  283  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  72.63 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  73.33 
 
 		 196 aa  278  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  78.49 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  70.05 
 
 		 190 aa  270  7e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  67.91 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  80.87 
 
 		 199 aa  264  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  63.59 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  63.44 
 
 		 189 aa  247  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 178 aa  238  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 178 aa  237  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 191 aa  232  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.99 
 
 		 181 aa  230  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.66 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.98 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  60.87 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  59.55 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 197 aa  224  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 182 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>