More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2603 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  95.06 
 
 		 243 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  69.29 
 
 		 247 aa  321  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  62.66 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  63.07 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  59.92 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  61.16 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  59.34 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  60.33 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  60.33 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  55.97 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  55.65 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  53.14 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  52.67 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  48.54 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.82 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.4 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  38.22 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.48 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.64 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2887  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>