More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1193 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  91.97 
 
 
274 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  81.39 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  81.39 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  81.39 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  76.75 
 
 
274 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.17 
 
 
275 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  62.87 
 
 
287 aa  325  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.76 
 
 
281 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  43.22 
 
 
270 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
270 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
270 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  40.07 
 
 
273 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
280 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 
280 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.74 
 
 
270 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 
270 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
274 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  40.22 
 
 
270 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
284 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
270 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.67 
 
 
967 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.37 
 
 
276 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
284 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.94 
 
 
279 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
283 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
280 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
286 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  36.5 
 
 
280 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
277 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  37.32 
 
 
291 aa  162  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  38.29 
 
 
278 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
247 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
273 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.85 
 
 
659 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
257 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
259 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
268 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
270 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.15 
 
 
260 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
254 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
260 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
262 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
797 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
251 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
264 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
263 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
271 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
261 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
264 aa  119  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
260 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
263 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.25 
 
 
260 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.21 
 
 
663 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.57 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
258 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
269 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
258 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
266 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
258 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
266 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.78 
 
 
657 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 
267 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
270 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
267 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
259 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>