More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0124 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  100 
 
 
264 aa  527  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  87.12 
 
 
264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  81.3 
 
 
270 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  81.3 
 
 
285 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  81.3 
 
 
285 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  69.7 
 
 
259 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  68.94 
 
 
259 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  69.03 
 
 
268 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  70.83 
 
 
259 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  67.8 
 
 
259 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  66.67 
 
 
259 aa  329  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  64.02 
 
 
257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  57.75 
 
 
257 aa  272  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  54.26 
 
 
256 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  55.25 
 
 
257 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  52.33 
 
 
257 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  53.46 
 
 
262 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.62 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  53.1 
 
 
257 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  47.92 
 
 
260 aa  235  7e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  47.89 
 
 
258 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  47.89 
 
 
258 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  49.62 
 
 
269 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  50 
 
 
253 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  46.92 
 
 
261 aa  221  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  47.67 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  45.56 
 
 
257 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  46.21 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  46.33 
 
 
262 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  45.17 
 
 
253 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  48.85 
 
 
257 aa  202  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  43.13 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  42.21 
 
 
254 aa  188  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  43.22 
 
 
232 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
261 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  42.6 
 
 
274 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
260 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
265 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
265 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  39 
 
 
257 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  37.69 
 
 
256 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  38.08 
 
 
256 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  37.69 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  37.31 
 
 
256 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  38.08 
 
 
258 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  39.62 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  37.07 
 
 
257 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  39.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
248 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
249 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  39.62 
 
 
260 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
249 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  39.31 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  39.31 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  39.31 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.71 
 
 
266 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  39.62 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  38.17 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  39.38 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  39.46 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
267 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 
257 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  38.02 
 
 
261 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
254 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  39.46 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  37.93 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  39.08 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  38.22 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.88 
 
 
250 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.5 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  37.98 
 
 
255 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
262 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10280  putative short-chain dehydrogenase  39.62 
 
 
266 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  37.16 
 
 
262 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  36.4 
 
 
256 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  38.7 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>