More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1606 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  100 
 
 		 368 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  50.91 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  48.64 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  47.09 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  49.02 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  47.08 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  45.48 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  42.51 
 
 		 368 aa  262  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  53.42 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  48.34 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  46.26 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  47.43 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  47.43 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  49.66 
 
 		 370 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  48.15 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  43.07 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  50.67 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  44.64 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.97 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  43.89 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  43.89 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  43.89 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  43.18 
 
 		 340 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  47.12 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  46.23 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  45.7 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  44.29 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  47.84 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  45.7 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  43.14 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  46.34 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  47.93 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  48.07 
 
 		 361 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.9 
 
 		 347 aa  230  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  50.52 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  46.76 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  50.7 
 
 		 360 aa  228  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  45.58 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3335  transport system permease protein  50.15 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  hitchhiker  0.00152467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.54 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0218  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  55.71 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4835  transport system permease protein  48.12 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  44.3 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  45.57 
 
 		 342 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  46.73 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0343  hemin ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0436  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.47 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1777  hemin ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  44.74 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1829  hemin ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.73 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0828  hemin ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1119  hemin ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  44.04 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  44.67 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  49.08 
 
 		 350 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  41.35 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  42.49 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  45.61 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4775  transport system permease protein  50.3 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  43.69 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  42.66 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.22 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.24 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.41 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5318  transport system permease protein  53.63 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  43.71 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  42.21 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  41.52 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2142  hemin ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4552  transport system permease protein  49.66 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00635879  hitchhiker  0.000000015041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4686  transport system permease protein  50.17 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165164  hitchhiker  0.0000000000187173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.42 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  39.63 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  43.59 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2093  hemin ABC transporter, permease protein  43.87 
 
 		 338 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  39.66 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  37.46 
 
 		 373 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39.34 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  44.98 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  39.31 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3619  transport system permease protein  44.57 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5423  ABC transporter permease  52.25 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  39.31 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.34 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  49.3 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  42.86 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.34 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.34 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.54 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62290  putative permease of ABC transporter  52.25 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00186765  normal  0.421287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  40.89 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  44.25 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.99 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.99 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.76 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  34.37 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  37.81 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4688  transport system permease protein  49.32 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>