More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2093 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2093  hemin ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 338 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0343  hemin ABC transporter, permease protein  90.08 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1777  hemin ABC transporter, permease protein  89.81 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0436  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  90.08 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1829  hemin ABC transporter, permease protein  90.62 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0828  hemin ABC transporter, permease protein  90.62 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1119  hemin ABC transporter, permease protein  90.62 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2142  hemin ABC transporter, permease protein  80.11 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  65.75 
 
 		 362 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  65.75 
 
 		 362 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4835  transport system permease protein  68.9 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3335  transport system permease protein  68.31 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  hitchhiker  0.00152467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4775  transport system permease protein  68.6 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5318  transport system permease protein  67.73 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0218  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  66.3 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  49.4 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  48.85 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.79 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  46.9 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  41.21 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  46.35 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  41.83 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  45.52 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  46.23 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  45.99 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  40 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  41.82 
 
 		 371 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  50.53 
 
 		 341 aa  231  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  42.82 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  44.7 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  44.7 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  44.7 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  44.24 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  42.16 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  43.07 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  44.95 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  42.17 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  41.33 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  44.67 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  43.55 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  45.83 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  43.4 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  43.55 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  48.56 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  42.37 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  41.04 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  47.86 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  39.88 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  43.58 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  46.9 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.68 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  44.37 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  43.88 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  44.88 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.02 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  44.09 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  43.83 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  41.78 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2833  transport system permease protein  45.18 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  47.04 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  44.99 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  41.91 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  44.05 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  45.18 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  43.06 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.12 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  47.54 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4552  transport system permease protein  47.96 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00635879  hitchhiker  0.000000015041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  46.42 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4688  transport system permease protein  47.96 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3619  transport system permease protein  43.32 
 
 		 379 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.34 
 
 		 365 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  35.83 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  43.99 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  45.07 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  45.07 
 
 		 338 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  44.67 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  44.67 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  36.83 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4686  transport system permease protein  47.93 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165164  hitchhiker  0.0000000000187173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 		 356 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.86 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0994  transport system permease protein  50.35 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00447104  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.29 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  44.52 
 
 		 360 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5423  ABC transporter permease  48.68 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.64 
 
 		 363 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.64 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3079  transport system permease protein  45.67 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21025  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.36 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62290  putative permease of ABC transporter  48.97 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00186765  normal  0.421287 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.04 
 
 		 348 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.83 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.73 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.94 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  31.59 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.04 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>