More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0441 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  100 
 
 
317 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  50.16 
 
 
321 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.9 
 
 
321 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  48.26 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  49.68 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  45.54 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  47.63 
 
 
321 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  45.96 
 
 
323 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  45.45 
 
 
318 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.37 
 
 
317 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  43.85 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  43.53 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  43.85 
 
 
321 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  43.85 
 
 
321 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  44.16 
 
 
321 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.85 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.85 
 
 
321 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  42.9 
 
 
321 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.53 
 
 
321 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  45.11 
 
 
316 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  40.06 
 
 
321 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  40.06 
 
 
321 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  40.06 
 
 
316 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.01 
 
 
784 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.98 
 
 
322 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  40.31 
 
 
316 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  39.94 
 
 
337 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  38.12 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  39.25 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  39.81 
 
 
323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  38.12 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  38.44 
 
 
316 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.19 
 
 
316 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.56 
 
 
323 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  39.43 
 
 
320 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.88 
 
 
316 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.12 
 
 
315 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  38.92 
 
 
317 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  38.89 
 
 
321 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  42.77 
 
 
317 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.8 
 
 
325 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  38.56 
 
 
788 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  37.35 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  37.35 
 
 
321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3958  ferredoxin  40.12 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60959  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  42.01 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  38.01 
 
 
322 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.37 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  39.38 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.32 
 
 
315 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  38.58 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.94 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  36.76 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  38.19 
 
 
315 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.75 
 
 
322 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  36.45 
 
 
321 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  37.31 
 
 
320 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  39.13 
 
 
320 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  38.8 
 
 
318 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  38.34 
 
 
332 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.32 
 
 
317 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  34.67 
 
 
318 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.22 
 
 
783 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.69 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  40.58 
 
 
319 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  36.24 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.81 
 
 
780 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  36.04 
 
 
319 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  38.12 
 
 
321 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.09 
 
 
331 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  39.74 
 
 
328 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.11 
 
 
313 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  39.53 
 
 
326 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.51 
 
 
782 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2623  ferredoxin  40.07 
 
 
299 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.74 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.05 
 
 
318 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  39.23 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.61 
 
 
783 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  36.88 
 
 
588 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  36.47 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  38.83 
 
 
318 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  38.61 
 
 
784 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  38.61 
 
 
784 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  38.61 
 
 
784 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  36.96 
 
 
316 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  35.11 
 
 
319 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  38.61 
 
 
784 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  36.96 
 
 
316 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  34.67 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  34.86 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  36.31 
 
 
330 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  33.96 
 
 
319 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  38.08 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.29 
 
 
784 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.29 
 
 
784 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  38.49 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  39.57 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  37.54 
 
 
344 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.97 
 
 
784 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>