More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl621 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  79.39 
 
 
395 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  802    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  89.34 
 
 
395 aa  733    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  78.12 
 
 
395 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  72.52 
 
 
395 aa  608  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.61 
 
 
395 aa  607  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.43 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73.43 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  72.52 
 
 
395 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  73.68 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  73.68 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  73.6 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  73.6 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.62 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  73.03 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  77.1 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  73.62 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  71.28 
 
 
395 aa  598  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.43 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.43 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  71.76 
 
 
395 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.43 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.43 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.86 
 
 
400 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  76.84 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  76.59 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  76.84 
 
 
395 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.86 
 
 
400 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  73.4 
 
 
396 aa  596  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  72.38 
 
 
396 aa  595  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.15 
 
 
397 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.74 
 
 
397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  76.08 
 
 
395 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  75.83 
 
 
396 aa  591  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.86 
 
 
400 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.91 
 
 
396 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.91 
 
 
396 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.74 
 
 
397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.68 
 
 
400 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.68 
 
 
400 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  74.11 
 
 
395 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  75.83 
 
 
394 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.66 
 
 
396 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.61 
 
 
400 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  76.08 
 
 
394 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  76.08 
 
 
394 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.74 
 
 
395 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.1 
 
 
399 aa  588  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  73.23 
 
 
397 aa  584  1e-166  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.41 
 
 
396 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.93 
 
 
399 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.07 
 
 
395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.07 
 
 
395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.38 
 
 
397 aa  586  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.38 
 
 
397 aa  586  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.93 
 
 
400 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  72.12 
 
 
394 aa  587  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  73.62 
 
 
400 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.23 
 
 
394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  70.85 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.91 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.91 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.14 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.14 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.48 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.48 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.74 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.74 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  71.65 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.18 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  69.75 
 
 
401 aa  577  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  70.99 
 
 
394 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.99 
 
 
394 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.48 
 
 
405 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  71.9 
 
 
400 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  71.9 
 
 
396 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  71.61 
 
 
400 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.38 
 
 
397 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.67 
 
 
399 aa  579  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.48 
 
 
405 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.13 
 
 
397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  68.92 
 
 
399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.14 
 
 
397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  71.39 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.65 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.63 
 
 
396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>