More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0133 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  69.85 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  61.24 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  51.03 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  51.72 
 
 		 154 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.72 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  52.45 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.68 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  50.35 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.83 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  48.12 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  66.04 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  53.24 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  54.26 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 150 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  53.52 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  49.26 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  60.18 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  50 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  63.55 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  64.36 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  63.37 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  63.37 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  47.73 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  59.13 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  61.62 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  54.7 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  54.7 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>