More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3945 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  44.39 
 
 		 928 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  44.39 
 
 		 928 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  62.72 
 
 		 979 aa  1225    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  74.95 
 
 		 976 aa  1535    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  43.1 
 
 		 915 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 930 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 		 933 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  44.67 
 
 		 906 aa  736    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  42.89 
 
 		 926 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 946 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  75 
 
 		 978 aa  1530    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 936 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 923 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 941 aa  694    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  74.82 
 
 		 979 aa  1528    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  70.95 
 
 		 1004 aa  1461    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 925 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 936 aa  686    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  43.42 
 
 		 915 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  42.89 
 
 		 926 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  42.89 
 
 		 926 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 896 aa  730    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 896 aa  725    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  41.63 
 
 		 921 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 956 aa  669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  57.68 
 
 		 915 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 930 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  61.68 
 
 		 1020 aa  1192    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  44.18 
 
 		 941 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  38.26 
 
 		 861 aa  664    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 907 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  61.87 
 
 		 1010 aa  1231    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 943 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 923 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.84 
 
 		 903 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 1022 aa  678    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  56.75 
 
 		 937 aa  1076    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  60.87 
 
 		 1000 aa  1215    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 917 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  42.44 
 
 		 934 aa  712    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  56.91 
 
 		 937 aa  1082    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  44.39 
 
 		 928 aa  748    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 922 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.77 
 
 		 892 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.75 
 
 		 939 aa  753    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  42.89 
 
 		 926 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  42.35 
 
 		 930 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  50.72 
 
 		 941 aa  929    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 934 aa  727    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 905 aa  702    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  52.79 
 
 		 924 aa  915    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  65.13 
 
 		 968 aa  1337    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 926 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 922 aa  688    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  61.58 
 
 		 1032 aa  1214    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  50.46 
 
 		 945 aa  913    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  38.48 
 
 		 944 aa  660    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  55.48 
 
 		 929 aa  1030    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  40.94 
 
 		 957 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 926 aa  735    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  62.5 
 
 		 1021 aa  1239    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 910 aa  695    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 944 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 913 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 921 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  63.07 
 
 		 1033 aa  1243    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  43.23 
 
 		 928 aa  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  61.66 
 
 		 1014 aa  1218    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 988 aa  676    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 916 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 923 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 927 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  53.07 
 
 		 935 aa  979    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  51.98 
 
 		 937 aa  920    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 917 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  56.54 
 
 		 937 aa  1074    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 928 aa  717    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  100 
 
 		 978 aa  2002    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 946 aa  653    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 951 aa  738    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  43.57 
 
 		 917 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 922 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 922 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 918 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 937 aa  711    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  57.44 
 
 		 928 aa  1097    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 917 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  43.47 
 
 		 913 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 921 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 932 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  44.29 
 
 		 928 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 918 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  42.54 
 
 		 935 aa  717    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 917 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 902 aa  718    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  43.69 
 
 		 911 aa  773    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 922 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 931 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  60.68 
 
 		 940 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  42.07 
 
 		 923 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>