159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0572 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
340 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  41.94 
 
 
451 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  34 
 
 
319 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  34.19 
 
 
316 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  34.21 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  32.57 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  33.12 
 
 
305 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  32.29 
 
 
345 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  28.53 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  31.03 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.49 
 
 
351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  31 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  29.94 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  29.72 
 
 
345 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  29.76 
 
 
354 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 
321 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  28.79 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.91 
 
 
355 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  31.52 
 
 
342 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  31.01 
 
 
337 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  46.08 
 
 
132 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  41.61 
 
 
336 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  29.23 
 
 
362 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28.66 
 
 
342 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  42.98 
 
 
320 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.21 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.51 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  28.95 
 
 
359 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  30.43 
 
 
368 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  42.98 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  41.32 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  42.98 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  29.84 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  27.89 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  26.12 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.56 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  28.1 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  39.34 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  36.8 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  38.64 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  38.56 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  39.1 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  35.2 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  29.39 
 
 
303 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.33 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  37.6 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  37.04 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.61 
 
 
306 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  27.34 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  32.61 
 
 
306 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  28.57 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  33.33 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  32.61 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  28.4 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  36.51 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.52 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  31.88 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  31.88 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  29.93 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  31.93 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  29.09 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  38.98 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.66 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.97 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.08 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.21 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  32.99 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  32.33 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  32.33 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.33 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  26.03 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  26.17 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  36.21 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  34.35 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.01 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  39.67 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  27.48 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  31.63 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  28.41 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  30.91 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  25.61 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  27.12 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  21.91 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  24.08 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.61 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  26.13 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.52 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  28.3 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>