More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0300 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
465 aa  927    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  55.48 
 
 
464 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  56.49 
 
 
465 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  55.58 
 
 
466 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  56.58 
 
 
467 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  58.11 
 
 
442 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  58.11 
 
 
442 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  58.88 
 
 
449 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  55.23 
 
 
443 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  60.09 
 
 
442 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  57.21 
 
 
439 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  55.76 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  56.12 
 
 
452 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  59.39 
 
 
441 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  56.01 
 
 
453 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  52.83 
 
 
537 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0129  flagellum-specific ATP synthase  51.02 
 
 
422 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  45.33 
 
 
454 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  43.79 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  46.67 
 
 
441 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  45.56 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  45.66 
 
 
440 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  42.86 
 
 
445 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  46.23 
 
 
450 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  45.22 
 
 
452 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  47.3 
 
 
441 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  47.04 
 
 
441 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  46.27 
 
 
451 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  53.43 
 
 
453 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  43.94 
 
 
441 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  46.02 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  47.12 
 
 
455 aa  326  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  44.9 
 
 
475 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  45.2 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  42.55 
 
 
437 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  44.85 
 
 
451 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  43.09 
 
 
445 aa  319  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  40.91 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  41.53 
 
 
443 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  43.4 
 
 
436 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  42.33 
 
 
438 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  44.44 
 
 
431 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  40.55 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  45.28 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.75 
 
 
474 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  46.11 
 
 
433 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  41.58 
 
 
427 aa  306  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  41.67 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  47.75 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  47.64 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  42.63 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  46.37 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  42.68 
 
 
451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.85 
 
 
439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.17 
 
 
435 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  40.95 
 
 
426 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  42.3 
 
 
442 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  45.7 
 
 
449 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  47.79 
 
 
439 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  42.23 
 
 
442 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  41.49 
 
 
445 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  42.16 
 
 
448 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  41.45 
 
 
451 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  45.7 
 
 
449 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 
436 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  41.91 
 
 
447 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  43.87 
 
 
439 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  43.86 
 
 
439 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  42.75 
 
 
445 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  42.89 
 
 
446 aa  299  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  42.75 
 
 
445 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  42.75 
 
 
445 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  42.75 
 
 
445 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  43.96 
 
 
445 aa  299  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  40.38 
 
 
446 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  42.36 
 
 
445 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  42.07 
 
 
441 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.54 
 
 
446 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  42.36 
 
 
445 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  42.36 
 
 
445 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  43.75 
 
 
446 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  42.36 
 
 
445 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  40.09 
 
 
446 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  39.95 
 
 
446 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  46.53 
 
 
452 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  41.18 
 
 
422 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  44.33 
 
 
435 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  42.57 
 
 
442 aa  295  2e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  39.52 
 
 
437 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  42.13 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  49.41 
 
 
446 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  42 
 
 
435 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  44.71 
 
 
443 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  44.44 
 
 
436 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  43.21 
 
 
437 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  44.53 
 
 
450 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  44.75 
 
 
445 aa  293  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.33 
 
 
448 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  46.32 
 
 
441 aa  293  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  42.2 
 
 
442 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>