More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1516 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
476 aa  975    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 
479 aa  775    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
480 aa  569  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
492 aa  443  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
505 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
493 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
494 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
489 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
493 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
493 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
514 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
493 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
494 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
492 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
493 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
493 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
500 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
509 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
503 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
509 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
490 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
487 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
493 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
504 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
493 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
502 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
502 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.96 
 
 
495 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
502 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
502 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
484 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
503 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
504 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
484 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
506 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
503 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
501 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
479 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
485 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
480 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
488 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
506 aa  365  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
484 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
501 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
495 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
477 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
495 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
491 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
496 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
466 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
500 aa  353  4e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
490 aa  348  9e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
468 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
465 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
507 aa  346  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
475 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
516 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
506 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
490 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
493 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
485 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
467 aa  339  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
491 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
480 aa  335  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
512 aa  334  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
469 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
462 aa  332  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
471 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
469 aa  332  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
488 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 
511 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
464 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
474 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
473 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
473 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
509 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
467 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
517 aa  329  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
467 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
476 aa  329  8e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
474 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
473 aa  327  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
474 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>