110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0163 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.09 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  60.55 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  37.25 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0404  carboxymuconolactone decarboxylase  42.17 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0332  carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.711458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  33.67 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  34 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  28.16 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.82 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  32.22 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  28.43 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  34.88 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.61 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  30.85 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.11 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.23 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  38.16 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  27.17 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.21 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.97 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.7 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  28.18 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  25.69 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  29.35 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.18 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  26.32 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.04 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  28.42 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  35.11 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  28.44 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  31.86 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.03 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  31.17 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  31.52 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  27.47 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1693  carboxymuconolactone decarboxylase  24 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.93 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2851  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.48842e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.26 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 		 124 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 		 111 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 129 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.25 
 
 		 123 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  24.56 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  36.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  26.74 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  27.96 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.73 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.61 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.85 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  31 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>