More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1152 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
296 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  96.28 
 
 
297 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  82.53 
 
 
304 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  63.29 
 
 
280 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  61.72 
 
 
294 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.82 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  60.69 
 
 
279 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.47 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.08 
 
 
291 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.1 
 
 
290 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.12 
 
 
295 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.89 
 
 
293 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.86 
 
 
293 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.01 
 
 
290 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.02 
 
 
293 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.9 
 
 
293 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.36 
 
 
291 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.36 
 
 
300 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.82 
 
 
293 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  56.21 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.46 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.92 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.08 
 
 
289 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.8 
 
 
300 aa  261  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  49.48 
 
 
300 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  56.18 
 
 
284 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.29 
 
 
288 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.7 
 
 
293 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.84 
 
 
281 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.18 
 
 
302 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.64 
 
 
281 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.6 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.37 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.31 
 
 
278 aa  215  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.59 
 
 
277 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.29 
 
 
281 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
277 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47.54 
 
 
276 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.55 
 
 
282 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.61 
 
 
287 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.83 
 
 
287 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.71 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  46.07 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
468 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  43.67 
 
 
323 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
492 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  42.31 
 
 
316 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.46 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  42.16 
 
 
319 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
498 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  43.54 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  42.67 
 
 
323 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  41.67 
 
 
323 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
479 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
486 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
472 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.41 
 
 
313 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  36.9 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  39.72 
 
 
297 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
476 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
464 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  37.68 
 
 
313 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
467 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
475 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
480 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.46 
 
 
331 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
504 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  33.92 
 
 
546 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
463 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
467 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
456 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
495 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.42 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
464 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.41 
 
 
330 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
481 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  33.83 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
485 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33 
 
 
490 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
492 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
318 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
494 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.48 
 
 
296 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  37.36 
 
 
292 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.95 
 
 
303 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
469 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  39.56 
 
 
300 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
488 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
444 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
477 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
464 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
477 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
506 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
485 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
465 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
441 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.26 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>