255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0206 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  52.65 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  55.38 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  38.41 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.71 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.57 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  30.75 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  34.6 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  33.86 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  29.47 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.55 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  30.77 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  30.87 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  31.96 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  30.87 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  31.43 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.77 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.37 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  30.89 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  30.86 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  29.97 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  32.31 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  31.76 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.42 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  26.48 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  29.02 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  31.37 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.34 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  27.64 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  27.64 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  27.64 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  29.91 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  29.64 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.35 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  27.64 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  29.94 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.76 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.51 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  30.61 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  31.17 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  30.61 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  30.61 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  34.29 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  29.41 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  27.95 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.19 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  31.17 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  30.18 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  27.33 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  28.4 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.77 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.09 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  29.01 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  30.25 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  32.21 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.7 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  28.84 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  29.27 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  31.17 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.06 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  28.93 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  28.93 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  29.97 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  32.48 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  32.48 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  30.89 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  32.05 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.21 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.1 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  31.29 
 
 		 317 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  30.07 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  28.57 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  32.11 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.48 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.64 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  28.35 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>