80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0144 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  95.77 
 
 
296 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  85.21 
 
 
294 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  46.35 
 
 
315 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  46.72 
 
 
313 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  47.08 
 
 
313 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  45.55 
 
 
283 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  44.74 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  46.95 
 
 
290 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  46.95 
 
 
283 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  48.31 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  40.21 
 
 
664 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  47.2 
 
 
287 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  38.7 
 
 
300 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  41.41 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  42.81 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  25.17 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
425 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
748 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  22.94 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  32.89 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
270 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.94 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  34.46 
 
 
474 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.94 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.94 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  23.94 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
891 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  26.76 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3576  glycosyl transferase  29.72 
 
 
410 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
305 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
841 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  33.1 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  29.87 
 
 
740 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  22.49 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
836 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  30.77 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  25.51 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  27.11 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
455 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  24.24 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
477 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
513 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
717 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
352 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  26.76 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
884 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.57 
 
 
355 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  32.39 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
717 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  26.98 
 
 
303 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>