More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2236 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 328 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  37.46 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  37.16 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  35.95 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  33.23 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  36.78 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  35.05 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.23 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  36.78 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.14 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  34.64 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.72 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.16 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.45 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.86 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.29 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.09 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.43 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.82 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.06 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.78 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.51 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.92 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.45 
 
 		 357 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  27.81 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.77 
 
 		 357 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.87 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  27.96 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.62 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.03 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.06 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.12 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.61 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.73 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.76 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.94 
 
 		 357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.65 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.74 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.36 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  27.54 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  33.66 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.22 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.57 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.99 
 
 		 411 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.87 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.52 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.92 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.38 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.55 
 
 		 411 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.36 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.33 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.89 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.69 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.32 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.61 
 
 		 399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.37 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.7 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.78 
 
 		 400 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.37 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.52 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  23.72 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 247 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  28.06 
 
 		 392 aa  99  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.08 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.65 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  26.54 
 
 		 400 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 401 aa  95.9  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 411 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.99 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  25.28 
 
 		 439 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  28.62 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  31 
 
 		 253 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  31.88 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.92 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3611  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.71 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1859  UDP-glucose pyrophosphorylase  30 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0389  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.84 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3313  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.17 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4272  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.79 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  27.19 
 
 		 387 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.84 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.38 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  26.79 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>