More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1017 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
275 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  68.75 
 
 
274 aa  341  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  60.29 
 
 
273 aa  289  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  60.29 
 
 
273 aa  284  9e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  53.46 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  53.08 
 
 
272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  61.68 
 
 
281 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  60.7 
 
 
269 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  57.41 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  53.23 
 
 
266 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  48.55 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  58.2 
 
 
273 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  57.42 
 
 
273 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  60.47 
 
 
269 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  56.2 
 
 
272 aa  255  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  50.57 
 
 
276 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  50.59 
 
 
268 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  58.58 
 
 
273 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  55.64 
 
 
269 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  48.62 
 
 
268 aa  235  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  46.49 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  45.08 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  42.91 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  48.3 
 
 
281 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
267 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  43.53 
 
 
279 aa  215  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  41.63 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
267 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
269 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  48.58 
 
 
264 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  44.67 
 
 
273 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  42.62 
 
 
274 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  41.51 
 
 
279 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  42.05 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  45.38 
 
 
277 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  37.36 
 
 
285 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  39.1 
 
 
267 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  37.59 
 
 
277 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  36.96 
 
 
267 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  40.16 
 
 
268 aa  168  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.7 
 
 
272 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.71 
 
 
272 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.06 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.4 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  34.89 
 
 
277 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  35.74 
 
 
272 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 
293 aa  160  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  35.2 
 
 
287 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  34.85 
 
 
268 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  33.85 
 
 
276 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.38 
 
 
304 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.07 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  34.07 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  34.07 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  34.07 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  34.07 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  33.6 
 
 
287 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.83 
 
 
280 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
272 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  32.59 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  34.55 
 
 
277 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
277 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  36.25 
 
 
300 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  35.87 
 
 
312 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  35.42 
 
 
312 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.33 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  33.82 
 
 
277 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32 
 
 
288 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
288 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  34.15 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.54 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  34.15 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  38.49 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.08 
 
 
264 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.36 
 
 
289 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.21 
 
 
280 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.02 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.57 
 
 
285 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.46 
 
 
281 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.35 
 
 
277 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.09 
 
 
289 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  29.81 
 
 
291 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  32.55 
 
 
277 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  33.58 
 
 
277 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  35.91 
 
 
300 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.74 
 
 
279 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  36.59 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.91 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1683  ABC-3 protein  36.12 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.58 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  32.85 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  35 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>