More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3509 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  100 
 
 		 588 aa  1205    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  58.7 
 
 		 604 aa  714    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  58.07 
 
 		 606 aa  707    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  59.45 
 
 		 589 aa  724    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  56.88 
 
 		 609 aa  703    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  59.49 
 
 		 589 aa  717    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  56.83 
 
 		 588 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  60.2 
 
 		 610 aa  731    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  74.83 
 
 		 589 aa  915    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  58.64 
 
 		 590 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  58.86 
 
 		 604 aa  731    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  61.37 
 
 		 584 aa  724    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  57.17 
 
 		 600 aa  687    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 586 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  52.89 
 
 		 590 aa  621  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  52.72 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  52.12 
 
 		 590 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  51.36 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  50 
 
 		 590 aa  597  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  48.05 
 
 		 595 aa  567  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  46.46 
 
 		 600 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.05 
 
 		 601 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  48.24 
 
 		 604 aa  529  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.27 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  45.03 
 
 		 590 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  44.44 
 
 		 611 aa  512  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  44.44 
 
 		 611 aa  512  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.19 
 
 		 589 aa  514  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  45.1 
 
 		 590 aa  511  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  44.21 
 
 		 623 aa  505  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  42.29 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  44 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.17 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.84 
 
 		 493 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  26.05 
 
 		 644 aa  113  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.84 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.73 
 
 		 500 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  24.7 
 
 		 644 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  26.64 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  23.87 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  26.07 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  23.03 
 
 		 634 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.09 
 
 		 646 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  23.63 
 
 		 489 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 		 622 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.79 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  26.07 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  25.36 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.2 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  35.33 
 
 		 240 aa  107  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  28.7 
 
 		 460 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  24.8 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  25.85 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  25.68 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.65 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  25.93 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.84 
 
 		 553 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  25.61 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  25.73 
 
 		 651 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  23.21 
 
 		 643 aa  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  25.14 
 
 		 564 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.6 
 
 		 670 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  36.59 
 
 		 249 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  24.23 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  25 
 
 		 630 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.05 
 
 		 557 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  25.22 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  23.17 
 
 		 928 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.87 
 
 		 240 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  23.78 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.87 
 
 		 240 aa  101  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  24.9 
 
 		 647 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  23.52 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  26.82 
 
 		 654 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.65 
 
 		 557 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 637 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.25 
 
 		 481 aa  100  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  25.1 
 
 		 543 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  25.1 
 
 		 543 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  25.1 
 
 		 543 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  26.82 
 
 		 656 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  25.94 
 
 		 600 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  25.94 
 
 		 600 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  24.9 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  26.95 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.6 
 
 		 502 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  25.35 
 
 		 631 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  24.95 
 
 		 654 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  24.57 
 
 		 922 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.06 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  24.75 
 
 		 630 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>