More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1729 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1729  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  79 
 
 		 99 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  37.78 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  31.82 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  30.68 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  29.21 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  32.32 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  31.37 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  36.25 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  30.69 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  28.09 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>