53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4207 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  100 
 
 		 360 aa  730    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  22.98 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  20.46 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  25 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  25 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  23.71 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  22.49 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  23.75 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  23.74 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  22.74 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  19.53 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  21.22 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  20.61 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  22.66 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  23.41 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  21.95 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  22.82 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  22 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1112  type II secretion system protein  22.86 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000155741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  24.13 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  23.08 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  21.83 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  26.69 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  22.14 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  25.54 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  23.67 
 
 		 403 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  25.32 
 
 		 403 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.41 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  22.31 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  21.07 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  25 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  22.14 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  22.14 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  23.88 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  20.33 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  22.14 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.3 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  19.83 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  22.5 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  24.21 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>