202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3468 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  56.45 
 
 
129 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  54.33 
 
 
130 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  54.84 
 
 
129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
208 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
208 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  35.04 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  39.2 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.52 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  38.4 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  39.2 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  36 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  32.2 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  29.91 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  31.9 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  29.06 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
208 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  35.43 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  31.62 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  29.57 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  30.43 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.36 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.57 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  27.83 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  29.75 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  26.05 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.48 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.06 
 
 
600 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.81 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  34.58 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  27.82 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.85 
 
 
216 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.85 
 
 
216 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  21.5 
 
 
586 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
215 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.97 
 
 
223 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
215 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  26.5 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  27.05 
 
 
238 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  27.34 
 
 
143 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.51 
 
 
1560 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.87 
 
 
282 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  26.02 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  22.03 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 
688 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  27.78 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  26.5 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.02 
 
 
598 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.06 
 
 
496 aa  48.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  26.67 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  32 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  27.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  31.93 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  28.16 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  27.69 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  29.85 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  30.58 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  29.13 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  30.51 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
208 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
250 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  27.07 
 
 
217 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  23.08 
 
 
589 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 
283 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
138 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  23.53 
 
 
139 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  25.76 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  24.58 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.15 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 
232 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.58 
 
 
496 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  29.51 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  31.78 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  29.17 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  27.05 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28.21 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  27.83 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.46 
 
 
499 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  31.2 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.63 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  25.81 
 
 
302 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  27.87 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>