253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0961 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 
253 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 
253 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
253 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  34.65 
 
 
254 aa  148  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
262 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  28.97 
 
 
253 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  27.41 
 
 
380 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  28.02 
 
 
310 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  30.65 
 
 
303 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 
328 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 
307 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  27.03 
 
 
287 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  23.44 
 
 
291 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  27.06 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  26.92 
 
 
342 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  28.24 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  24.11 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  25.1 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  23.72 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  26.74 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  25.88 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  26.36 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  24.31 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  27.01 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  27.74 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  30.14 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  27.5 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  28.85 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  32.47 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  30.38 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  29.88 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  32.47 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  32.47 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  32.47 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  29.87 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  42.47 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  29.22 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  29.22 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  29.22 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  29.87 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  31.82 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  24.49 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  29.87 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  39.33 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  29.87 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  29.09 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  24.35 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  22.97 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  23.58 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  24.35 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  23.47 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  30.12 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  24.35 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  28.08 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  27.27 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  27.92 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  26.25 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  26.35 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  28.77 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  28.77 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  34.29 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  35.24 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  28.87 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  26.7 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  27.04 
 
 
290 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  27.4 
 
 
255 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  27.4 
 
 
255 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  27.4 
 
 
255 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  31.17 
 
 
262 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.29 
 
 
262 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  28.66 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  24.37 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  29.87 
 
 
266 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  36.19 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  29.87 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  25.15 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  24.6 
 
 
253 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  24.32 
 
 
271 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  28.1 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  28.1 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  23.72 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  28.1 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  28.1 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  30.13 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  24.52 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  27.78 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  28.1 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  24.48 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  23.16 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  24.52 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  25.15 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  24.85 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  23.02 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>