159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1220 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  89.72 
 
 		 262 aa  470  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  48.22 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  31.42 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  28.52 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  28.69 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  26.46 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  26.27 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  28.44 
 
 		 303 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  29.55 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  24.8 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  24.33 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  27.46 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  25.48 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  30.06 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  30.72 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  30.72 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  30.72 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  27.56 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  29.2 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  27.74 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  25.09 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  25.45 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  31.79 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  30.43 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  24.01 
 
 		 458 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  30.06 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  29.81 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  30.72 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  28.47 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  39.19 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  26.01 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  27.95 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  28.47 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  25.55 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  22.11 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27.4 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  27.57 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  29.81 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  28.68 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.49 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.49 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  26.69 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2730  TatD family hydrolase  31.43 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  25.59 
 
 		 606 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0151  TatD-related deoxyribonuclease  28.26 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  26.24 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  27.74 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  26.86 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  26.83 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  27.01 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  27.95 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1575  TatD-related deoxyribonuclease  25.09 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  31.47 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  33.75 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0329  Aryldialkylphosphatase  25.15 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.369363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  25.37 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  25.27 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  25.37 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  27.89 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  37.33 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  25.96 
 
 		 462 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  28.66 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  24.55 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.28 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1051  TatD-related deoxyribonuclease  24.91 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  38.96 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  29.58 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  27.01 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  25.63 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  25.9 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0826  TatD-related deoxyribonuclease  23.94 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.921245  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  25.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  27.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  29.79 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  27.01 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  27.01 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  25.74 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  25.17 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  27.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  25.74 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>