More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0551 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  100 
 
 		 328 aa  655    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  62.88 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  57.37 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  58.49 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  58.49 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  57.5 
 
 		 343 aa  401  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  57.23 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  60.46 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf179  recombinase A  58.88 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  56.07 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  56.74 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  54.4 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  57.01 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  55.66 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  56.83 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  55.94 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  56.78 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  55.66 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  54.37 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  56.29 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  55.31 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  56.29 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  55.97 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  56.29 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  55.31 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  57.23 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  55.97 
 
 		 359 aa  391  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  56.29 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  56.21 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  54.72 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  55.17 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  57.5 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  57.86 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  55.17 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  54.04 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  54.72 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  55.97 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  54.69 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  53.42 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  59.48 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  55.35 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  57.38 
 
 		 385 aa  388  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  56.92 
 
 		 348 aa  384  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  55.42 
 
 		 362 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  55.66 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  55.35 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  55.52 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  57.28 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  56.33 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  55.66 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  56.43 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  56.35 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  55.73 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  56.78 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  55.66 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  54.23 
 
 		 349 aa  384  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  58.96 
 
 		 364 aa  384  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  54.72 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  55.11 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  56.69 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  54.75 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  56.92 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  53.87 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  55.66 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  57.37 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  54.97 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  54.49 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  53.68 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  54.49 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  54.09 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  57.28 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  56.69 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  56.29 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  53.7 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  56.03 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  55.14 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  58.28 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  55.94 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  55.56 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  55.73 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  58.42 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  56.52 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  59.21 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  54.49 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  55.35 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  54.35 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  55.52 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  60.81 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  54.55 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  54.4 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  52.83 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  61.33 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  54.32 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  57.5 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  52.2 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  55 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  56.95 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  56.25 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  55.94 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  55.62 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>