66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1120 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  39.79 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  35.64 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  40.62 
 
 		 281 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  40.1 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  42.63 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  28.67 
 
 		 314 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  32.99 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.43 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  27.54 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  29.51 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  30.54 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  27.51 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  26.02 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  35.62 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  31.52 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  36.26 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  28.08 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  28.02 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  27.83 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1305  general secretory pathway protein K  27.8 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  29.02 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  26.62 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  27.83 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  36.02 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  36.02 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  26.85 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.25 
 
 		 586 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  31.25 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  31.43 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  27.06 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  25.97 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  24.6 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0682  general secretory pathway protein K  26.91 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.0114744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25.93 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  30 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2099  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165009  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3145  general secretion pathway protein K, putative  25.57 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.132735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  25.91 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  24.75 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  26.52 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  31.18 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  25.78 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  22.75 
 
 		 328 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  23.33 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  25.78 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  28.8 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  24.22 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  22.83 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  24.54 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  23.32 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  26.12 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  22.37 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  28.78 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  22.94 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16110  hypothetical protein  26.48 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.939535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.79 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3226  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000103936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>