260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0791 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  100 
 
 		 413 aa  806    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  50.51 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  54.29 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  49.14 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  49.15 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  50.38 
 
 		 397 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  41.71 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  41.71 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  42.42 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  42.79 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  37.11 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  36.91 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  35.28 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  34.57 
 
 		 436 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  36.18 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  36.5 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  35.22 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  32.9 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  32.41 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  31.02 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  33.25 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.51 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  30.93 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.86 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  35.88 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  35.75 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  34.14 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  30.7 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  34.76 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.27 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  32.51 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  30.92 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  31.29 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  29.44 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  34.05 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.92 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.36 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  34.05 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.75 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  34.15 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.82 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.02 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  29.48 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.56 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  28.61 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.07 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  30.22 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.75 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  28.46 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.03 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.87 
 
 		 426 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.13 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  23.82 
 
 		 447 aa  99.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  27.35 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  22.84 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  26.85 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.57 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.4 
 
 		 577 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.48 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.34 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.89 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  30.11 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.34 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.71 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  31.34 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  23.6 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  27.43 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  28.98 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  27.19 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  28.02 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.37 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  29.55 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  30.68 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  29.55 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  28.02 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  29.18 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.11 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  27.73 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  27.73 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  26.08 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  27.73 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  32.89 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  27.73 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  27.73 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  27.73 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  23.96 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.49 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.49 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  27.43 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  30.71 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  30.71 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  30.2 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  27.47 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.05 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  30.75 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  30.4 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  30.36 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.67 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  28.67 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.29 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>