More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf423 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  58.33 
 
 
166 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 
166 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 
166 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 
166 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 
166 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  57.69 
 
 
164 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 
168 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 
166 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  56.77 
 
 
168 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 
166 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  53.05 
 
 
168 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 
166 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  52.44 
 
 
167 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  50.93 
 
 
166 aa  165  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
180 aa  164  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
172 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 
171 aa  164  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
172 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 
169 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  55.33 
 
 
166 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
166 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  54.43 
 
 
167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  60.43 
 
 
147 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
172 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
172 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
172 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  53.16 
 
 
167 aa  161  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  50.97 
 
 
166 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 
166 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 
166 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
179 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
163 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
203 aa  160  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
180 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 
172 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 
147 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 
189 aa  159  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
165 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
165 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
166 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  55.71 
 
 
147 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 
169 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 
206 aa  158  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  50.65 
 
 
173 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  51.68 
 
 
169 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  58.57 
 
 
147 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  51.68 
 
 
169 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  51.66 
 
 
163 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  49.36 
 
 
165 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  56.12 
 
 
158 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 
168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
163 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  53.06 
 
 
161 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  48.43 
 
 
165 aa  154  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  52.74 
 
 
163 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  46.99 
 
 
168 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  50.64 
 
 
168 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 
146 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 
163 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  52.7 
 
 
182 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 
165 aa  153  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  52.67 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
168 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  55.4 
 
 
147 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  52.94 
 
 
172 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  55.4 
 
 
147 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  55.4 
 
 
147 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  51.66 
 
 
162 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
164 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  48.32 
 
 
176 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0784  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 
173 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0281863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
194 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  48.1 
 
 
176 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
174 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  48.68 
 
 
165 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  45.51 
 
 
167 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  49.66 
 
 
159 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  44.94 
 
 
172 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  54.68 
 
 
146 aa  148  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 
168 aa  148  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 
225 aa  148  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 
178 aa  148  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  48.39 
 
 
167 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 
178 aa  148  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  50.64 
 
 
182 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 
222 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
162 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  50 
 
 
169 aa  148  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  45.24 
 
 
175 aa  147  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>