More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0784 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0784  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  51.15 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  59.33 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.59 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  53.59 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  52.32 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  52.32 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  51.76 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  48.78 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  51.76 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  53.59 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 172 aa  170  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  49.4 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  53.9 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  50.99 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.33 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  50.98 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  55.19 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 163 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  49.14 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  49.1 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  54.04 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 225 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  49.39 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  49.39 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  49.1 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  48.78 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>