81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01315 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.37 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.51 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  31.68 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25.87 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  34.78 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.87 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.97 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.87 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.2 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.99 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.29 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.49 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  32.17 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  27.69 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.27 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.12 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.05 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  24.84 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  25.71 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  24.43 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.3 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  24.86 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.85 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  26.88 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  31.36 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  31.36 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  31.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  31.36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  25.44 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  27.96 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  23.6 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  26.72 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  26.72 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  33.68 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  25.73 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.98 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  28.45 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  37.04 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  24.12 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  27.2 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  26.7 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  25.73 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  23.46 
 
 		 267 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 251 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  31.17 
 
 		 206 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>