More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6694 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  77.17 
 
 		 566 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  65.06 
 
 		 562 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  64.29 
 
 		 561 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  91.74 
 
 		 557 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  77.36 
 
 		 566 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  66.25 
 
 		 557 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  77.48 
 
 		 565 aa  736    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  64.82 
 
 		 561 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  64.46 
 
 		 561 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  65 
 
 		 561 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1063    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  63.48 
 
 		 565 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  82.94 
 
 		 557 aa  837    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  64.21 
 
 		 553 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  60.29 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  60.85 
 
 		 557 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  64.46 
 
 		 561 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  60.48 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  60.7 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  60.7 
 
 		 559 aa  616  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  59.41 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  61.48 
 
 		 558 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  59.96 
 
 		 554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  62.52 
 
 		 554 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  55.62 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  57.01 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 		 549 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  53.39 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  50.71 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  48.26 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  52.08 
 
 		 547 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  49.45 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  49.26 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 554 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  47.46 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  51.75 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48.52 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  47.33 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  51.34 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  48.84 
 
 		 564 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.56 
 
 		 559 aa  347  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  40.24 
 
 		 560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.31 
 
 		 559 aa  333  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  37.92 
 
 		 559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.19 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.86 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  35.18 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.16 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.5 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.04 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.23 
 
 		 552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 552 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 558 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 558 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.88 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 573 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.69 
 
 		 589 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  35.26 
 
 		 557 aa  302  9e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 557 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 583 aa  299  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 558 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.96 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.45 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 564 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 557 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 568 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.28 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.34 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.05 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.06 
 
 		 608 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.62 
 
 		 554 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 579 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.15 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 568 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>