More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5695 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  92.41 
 
 		 290 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  78.28 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.33 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.93 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.99 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 603 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  40 
 
 		 603 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.65 
 
 		 603 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 288 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.46 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.97 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 287 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.93 
 
 		 607 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.11 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.64 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.38 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19640  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, permease component  38.13 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.45 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  32 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.12 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.07 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.07 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.78 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>