More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5293 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  84.71 
 
 		 447 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 421 aa  835    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  74.76 
 
 		 421 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  39.72 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  42.66 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  45.15 
 
 		 721 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  45.33 
 
 		 729 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  37.64 
 
 		 675 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  44.88 
 
 		 643 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  39.57 
 
 		 681 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.98 
 
 		 758 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 687 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 		 1172 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.07 
 
 		 696 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 		 696 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  40.09 
 
 		 699 aa  159  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  36.4 
 
 		 746 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  56.62 
 
 		 677 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.5 
 
 		 701 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  40.1 
 
 		 701 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  41.01 
 
 		 752 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 1180 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 		 1207 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 		 1156 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  55.47 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 		 284 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  54.35 
 
 		 663 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 		 641 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.95 
 
 		 694 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.44 
 
 		 936 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.87 
 
 		 753 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.29 
 
 		 656 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  37.62 
 
 		 670 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  42.86 
 
 		 635 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.47 
 
 		 726 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 756 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.58 
 
 		 737 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.83 
 
 		 657 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  32.58 
 
 		 701 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 		 859 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.2 
 
 		 701 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 712 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.48 
 
 		 729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  35.74 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  34.23 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 665 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 		 645 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.96 
 
 		 758 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.68 
 
 		 764 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.33 
 
 		 971 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  36.2 
 
 		 643 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 		 734 aa  133  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.29 
 
 		 758 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  24.94 
 
 		 1119 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 		 911 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  35.07 
 
 		 717 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 		 864 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 		 702 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.99 
 
 		 760 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  40.97 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 735 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.66 
 
 		 355 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 		 860 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35 
 
 		 637 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 903 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.6 
 
 		 703 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.04 
 
 		 658 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 607 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 		 741 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.53 
 
 		 577 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 		 794 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  37.28 
 
 		 536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.8 
 
 		 879 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 		 713 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 		 382 aa  126  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  38.71 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 969 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.49 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.49 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.62 
 
 		 761 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.61 
 
 		 648 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.78 
 
 		 638 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 724 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.97 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.53 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  30.6 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 		 561 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.4 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 858 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 667 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  37.44 
 
 		 650 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  32 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>