More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4619 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  74.48 
 
 		 533 aa  823    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  100 
 
 		 544 aa  1102    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  48.04 
 
 		 534 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  47.72 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  45.79 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  45.79 
 
 		 598 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  42.88 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  42.94 
 
 		 532 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  41.94 
 
 		 557 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  42.62 
 
 		 560 aa  425  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  41.37 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  41.49 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  40.22 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 		 539 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  39.77 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.84 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.22 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 521 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.91 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 520 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.64 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.85 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.12 
 
 		 520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 		 529 aa  141  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 534 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 517 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.05 
 
 		 543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.59 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.39 
 
 		 527 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 544 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  24.41 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.41 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.41 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  24.41 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 517 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.41 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.9 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  25.99 
 
 		 541 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  25.21 
 
 		 589 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.47 
 
 		 524 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.2 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 522 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.97 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.99 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 531 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.99 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.73 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 534 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>