52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4071 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4071  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  38.58 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  38.53 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 229 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1317  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000865545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 237 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  34.51 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1716  Cro/CI family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000130124  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  40.98 
 
 		 209 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4003  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1308  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019995  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3278  hypothetical protein  29.27 
 
 		 110 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 513 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2846  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 443 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.675443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 263 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1114  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21850  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000342125  hitchhiker  0.00251437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  50 
 
 		 517 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 143 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 513 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1596  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.91 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000735944  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.14 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1266  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461097  normal  0.0226828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.72 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 490 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>