27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21850  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000342125  hitchhiker  0.00251437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1864  putative transcriptional regulator  89.32 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1317  XRE family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000865545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1716  Cro/CI family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000130124  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4003  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1308  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019995  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1266  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461097  normal  0.0226828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1596  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.29 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000735944  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3888  hypothetical protein  52.34 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1673  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189543  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35190  DNA-binding protein  57.69 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 504 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  50.94 
 
 		 414 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0019  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0401744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>