242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3036 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  100 
 
 		 439 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  76.58 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  59.23 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  38.39 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  40.15 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  38.12 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  38.3 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  36.87 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  35.68 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  39.03 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  38.06 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  39.64 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  36.23 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  38.02 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  36.54 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  37.96 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  35.07 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.38 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  36.01 
 
 		 422 aa  146  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.65 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  38.35 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  36.25 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  35.77 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.02 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  35.81 
 
 		 480 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  36.73 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  37.59 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  35.31 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  33.74 
 
 		 409 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  34.81 
 
 		 430 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  35.05 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.05 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  31.81 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  34.95 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  32.78 
 
 		 463 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  34.81 
 
 		 429 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.81 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  31.6 
 
 		 485 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  33.42 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  33 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  32.19 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  35.79 
 
 		 504 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.65 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  28.68 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.43 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  34.63 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  32.9 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.5 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  33.06 
 
 		 1199 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  31.78 
 
 		 450 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  32.22 
 
 		 418 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.83 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.82 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  31.74 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.29 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  35.14 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.89 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.65 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  35.82 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.09 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.16 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.66 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.74 
 
 		 1274 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  32.85 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  23.82 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.5 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.71 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  27.53 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  30.32 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  31.01 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.34 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  23.78 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  44.12 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  40.4 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 487 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  51.56 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.73 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  27.4 
 
 		 999 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.73 
 
 		 619 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  40.58 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.51 
 
 		 616 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.77 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.48 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  47.69 
 
 		 537 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.82 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  43.9 
 
 		 469 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.85 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  25.4 
 
 		 565 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  22.69 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 578 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  50.79 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.17 
 
 		 625 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.35 
 
 		 657 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.23 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.12 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>