91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0915 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  100 
 
 		 316 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  43.23 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  42.16 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  40.32 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  33.88 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  35.97 
 
 		 322 aa  178  8e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  39.3 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  36.36 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  34.42 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  34.42 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  33.99 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  36.5 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.4 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  30.5 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  33.1 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  31.89 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  34.04 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  30.26 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  28.2 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.28 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  30.25 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.23 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  30.17 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  30.69 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  27.69 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  29.65 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  26.99 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  26.99 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  27.87 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.25 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  28.67 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  30.29 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  30.82 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  28.21 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  25.7 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.8 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  30.49 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  25.81 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  25.81 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  27.21 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  30.04 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.5 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  25.7 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  24.86 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  28.72 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  22.67 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  30.82 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  33.33 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  28.11 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  30.63 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  31.45 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  24.44 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  23.55 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.3 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.85 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  22.79 
 
 		 735 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.76 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  26.61 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  21.6 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.65 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  31.2 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  30.39 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  35.48 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  23.41 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  29.08 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  22.67 
 
 		 387 aa  45.8  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  25.99 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  22.15 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  23.56 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  35 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  30.92 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  34.18 
 
 		 518 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  22.89 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.7 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  26.91 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  30.11 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  25 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  25.76 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  35.37 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  34 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  25.48 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  27.84 
 
 		 524 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  24.87 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  42.11 
 
 		 488 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  27.5 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  21.15 
 
 		 394 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>