More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0187 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
212 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
213 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518824  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
207 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41546  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
210 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
211 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
235 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0139749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
236 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.660466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0267  quaternary amine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.54 
 
 
526 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2357  amino acid ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0084  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  36.99 
 
 
528 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.689632  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1923  glycine betaine transport system permease protein  34.02 
 
 
526 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3032  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.19 
 
 
531 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15750  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  36.69 
 
 
213 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2785  quaternary amine ABC transporter permease  31.31 
 
 
384 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5205  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  36.67 
 
 
537 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.057164  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1330  quaternary amine ABC transporter permease  31.31 
 
 
384 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
384 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
211 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
211 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
386 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.706116  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
218 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
245 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
243 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1687  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.69 
 
 
216 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.296166  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
216 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2030  amino acid ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 
211 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.207242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
400 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
218 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
242 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.733782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1070  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.33 
 
 
525 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.019749  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0243  amino acid ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 
211 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
212 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0119  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.11 
 
 
523 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124345  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
228 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
220 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
234 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225849  normal  0.0541787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
519 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
522 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0875398  normal  0.252786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
235 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1515  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.25 
 
 
526 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0692577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2494  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 
216 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
220 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485727  normal  0.10095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
392 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
385 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1686  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.89 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038351  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0902932  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2993  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.208767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7552  ABC glycinebetaine/carnitine/choline transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8180  ABC transporter membrane spanning protein (proline/glycine/betaine)  31.25 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3333  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29 
 
 
524 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000937167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.132405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.311538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
222 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.721959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4576  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4250  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.34 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
525 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.615651  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
383 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease/glycine betaine/L-proline-binding protein  37.22 
 
 
517 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0522  glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, permease/substrate-binding protein  37.22 
 
 
517 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.271995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3337  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.81 
 
 
519 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  0.224892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459118  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37590  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  33.93 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
389 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001529  probable inner-membrane permease  31.65 
 
 
199 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0486  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00597716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0914  quaternary amine ABC transporter permease  29.44 
 
 
385 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664933 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
385 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.782089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
385 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.89368  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
216 aa  91.3  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2419  quaternary amine ABC transporter permease  29.44 
 
 
385 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3255  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  29.44 
 
 
385 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687244 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.245299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02060  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.97 
 
 
385 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1218  ABC transporter permease  36.77 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0386  ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
504 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2265  quaternary amine ABC transporter permease  28.97 
 
 
385 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0804  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.85 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02018  hypothetical protein  28.97 
 
 
385 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2353  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  31.8 
 
 
377 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13610  ABC transporter permease  35.12 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2251  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.69 
 
 
515 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471991  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2784  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.41 
 
 
504 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694048 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0914  choline ABC transporter permease and substrate binding protein  29.67 
 
 
500 aa  89  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>