291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0159 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  51.03 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  41.58 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  32.99 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  33.33 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  32.65 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  33.11 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  33.11 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  32.65 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  32.77 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  33.11 
 
 		 325 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  32.44 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  32.07 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  32.07 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  32.07 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  31.62 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  31.72 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  32.09 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31.42 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.8 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  25.89 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  26.5 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  26.37 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  27.51 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  25.75 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  33.84 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  23.26 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  25.4 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  25.61 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  30.26 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  26.22 
 
 		 628 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  26.22 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  22.79 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  26.64 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  24.01 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  24.92 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.5 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  26.04 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  19.86 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  22.18 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  24.16 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.98 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  26 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  27.98 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  24.38 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.01 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  22.56 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  25.13 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.58 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.98 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  26.34 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.98 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  27.78 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  25.41 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.35 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.87 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.87 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.42 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.87 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.51 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  24 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  22.73 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  22.44 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.15 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  23.78 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  22.39 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.15 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.15 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  21.72 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.15 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  21.72 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  23.9 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.47 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  22.64 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.15 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  20.14 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  23.3 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  25 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.7 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.57 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  38.96 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  21.45 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  22.95 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  23.71 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  27 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  29.23 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.07 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.93 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  24.81 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  30 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  24.19 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>