More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1624 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 363 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 		 363 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 		 376 aa  308  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  43.3 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  47.63 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  42.08 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  42.42 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  45.98 
 
 		 361 aa  275  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  41.31 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  41.64 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  40.8 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  41.5 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  41.31 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  41.09 
 
 		 404 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.51 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  34.79 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.78 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  31.41 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.34 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  34.83 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.14 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.14 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.48 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.14 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.14 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.14 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.86 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.14 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  33.51 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.03 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  33.87 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  32.62 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  32.71 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.76 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.8 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.04 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  31.73 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.69 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.67 
 
 		 404 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.31 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.23 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  28.42 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  28.42 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  28.42 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.96 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.96 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.06 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  28.69 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  29.57 
 
 		 666 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.35 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  26.49 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.51 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  28.42 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.91 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  28.14 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 		 666 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  30.62 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.68 
 
 		 1033 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.62 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  30.54 
 
 		 652 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  29.71 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  26.15 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.68 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.33 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 379 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.7 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  29.3 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.9 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 684 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  31.2 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>