214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0867 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  100 
 
 		 469 aa  929    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  929    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 		 469 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 513 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 485 aa  93.6  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  24.24 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 506 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  22.59 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  22.59 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.92 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.21 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.21 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.21 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.21 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.21 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.92 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  21.27 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 501 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 473 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.92 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.92 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 466 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 507 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  21.85 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  23.19 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.8 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.08 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  20.78 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.4 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.69 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  22.61 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  21.81 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  22.98 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.32 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  21.08 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  20.88 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 477 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 		 496 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  23.06 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 513 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0213  putative transport protein YifK  23.64 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 495 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 483 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  20.65 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  24.32 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  21.84 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  21.85 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  24.07 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  20.35 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  22.07 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  20.65 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  25.76 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  23.91 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  20.35 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  24.71 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  20.65 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>