214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3654 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  76.75 
 
 		 271 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  77.7 
 
 		 271 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  68.32 
 
 		 267 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  67.3 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  70.04 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  61.74 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  61.05 
 
 		 271 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  59.07 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  56.52 
 
 		 287 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  56.92 
 
 		 284 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  57.26 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  49.15 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  44.18 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.93 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  44.06 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  45.96 
 
 		 266 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  43.5 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  36.9 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.71 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  44.58 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  35.66 
 
 		 390 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  36.05 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  35.66 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  35.39 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  32.58 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.86 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  22.35 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.43 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  19.8 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  22.4 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.05 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  21.4 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  20.6 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.02 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.13 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  22.07 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  20.4 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  20.4 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  21.34 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  20.4 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.09 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  39.25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42666  predicted protein  28.47 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>